Pre-announcement: Upcoming Guidance for Submitting Whole Genome Sequencing (WGS) Data for Microorganisms
The New Substances Program is pleased to announce the upcoming publication of the Guidance for the Submission of Whole Genome Sequencing Data for Microbial Identification and Risk Assessment, which is to be published in the guidance documents section of the New substances: Organisms page of the ECCC website in fall 2026.
WGS is the current gold standard for microbial identification and may be used to detect genetic elements associated with pathogenicity, toxicity, or other hazards. As the submission of WGS data for new microorganism notifications in Canada has grown significantly, this document provides clear, standardized guidance on data submission expectations, analytical approaches, and recommended quality metrics.
Key Takeaways for Regulated Parties:
- Designed to Assist: This guidance helps streamline submissions when you choose to use WGS data.
- No Added Burden: This document does not impose any new regulatory requirements.
- Flexible Methods: While WGS provides comprehensive data, it remains optional. Traditional, non-WGS identification methods described in existing guidance remain fully valid.
For any inquiries, please contact the Substances Management Information Line by email at [email protected] or by telephone at 1-800-567-1999 (within Canada) or 819-938-3232 (international).
Kind regards,
New Substances program (Organisms)
Environment and Climate Change Canada and Health Canada
Website: New Substances program - Canada.ca
Prochaines recommandations relatives au séquençage du génome complet, issues du programme Nouvelles substances (organismes)
Annonce préalable : publication prochaine d’un guide sur la soumission des données de séquençage du génome entier (SGE) pour les micro-organismes
Le Programme des substances nouvelles a le plaisir d’annoncer la publication prochaine du guide intitulé « Guide pour la soumission des données de séquençage du génome entier aux fins de l’identification des micro-organismes et de l’évaluation des risques », qui devrait être mis en ligne sur la section Documents d'orientation et fiches d'information de la page « substances nouvelles: organismes vivants » du site Web d’ECCC cet automne 2026.
Le séquençage du génome entier (SGE) est la référence actuelle en matière d’identification microbienne et peut être utilisé pour détecter des éléments génétiques associés à la pathogénicité, à la toxicité ou à d’autres dangers. Puisque la soumission de données SGE pour des déclarations de nouveaux micro-organismes ayant considérablement augmenté au Canada, ce document fournit des orientations claires et normalisées sur les attentes en matière de présentation des données, les approches analytiques et les paramètres de qualité recommandés.
Points clés à retenir pour les parties assujetties à la réglementation :
• Conçu pour vous aider : ce guide permet de simplifier les soumissions lorsque vous choisissez d’utiliser des données de séquençage du génome entier (SGE).
• Aucune charge supplémentaire : ce document n’impose aucune nouvelle exigence réglementaire.
• Méthodes flexibles : bien que le séquençage du génome entier (SGE) fournisse des données exhaustives, il reste facultatif. Les méthodes d’identification traditionnelles, autres que le SGE, qui sont décrites dans les guides existants restent pleinement valables.
Pour toute demande de renseignements, veuillez communiquer avec la Ligne d’information de la gestion des substances par courriel à [email protected] ou par téléphone au 1-800-567-1999 (au Canada) ou au 819-938-3232 (international).
Cordialement,
Programme des substances nouvelles (Organismes)
Environnement et Changement climatique Canada et Santé Canada